In der Plenarversammlung sind die Vorsteherinnen und Vorsteher der 26 kantonalen Bildungs- oder Erziehungsdepartemente vertreten. Das Fürstentum Liechtenstein wirkt als ständiger Gast mit und hat beratende Stimme.
Die Geschäfte werden vom EDK-Vorstand vorbereitet. Er setzt sich aktuell wie folgt zusammen:
Conseiller d’État Christophe Darbellay
Département de l’économie et de la formation du canton du Valais / Departement für Volkswirtschaft und Bildung des Kantons Wallis
Vize-Präsident
Regierungsrat Alfred Stricker
Departement Bildung und Kultur des Kantons Appenzell Ausserrhoden
Regierungsrätin Christine Häsler
Bildungs- und Kulturdirektion des Kantons Bern / Direction de l’instruction publique et de la culture du canton de Berne
Regierungsrätin Monica Gschwind
Bildungs-, Kultur- und Sportdirektion des Kantons Basel-Landschaft
Conseillère d’Etat Sylvie Bonvin-Sansonnens
Direction de la formation et des affaires culturelles du canton de Fribourg / Direktorin für Bildung und kulturelle Angelegenheiten des Kantons Freiburg
Conseillère d’Etat Anne Hiltpold
Département de l’instruction publique, de la formation et de la jeunesse du canton de Genève
Consigliera di Stato Marina Carobbio Guscetti
Dipartimento dell’educazione, della cultura e dello sport del Cantone Ticino
Zur Erleichterung und Förderung der Zusammenarbeit haben sich die Kantone zu vier Regionalkonferenzen zusammen geschlossen: Westschweiz und Tessin, Nordwestschweiz, Zentralschweiz und Ostschweiz. Diese behandeln Aufgaben auf regionaler Ebene, z.B. regionale Schulabkommen oder sprachregionale Lehrpläne.